มหันตภัยแห่งธรรมชาติและไททันยักษ์ทั้งสองกำลังจะปะทะกันอีกครั้ง เมื่อก็อดซิลล่า จอมสัตว์ประหลาดจากทะเลลึก เกิดอาละวาดทั่วโลกโดยไร้สาเหตุ มนุษยชาติจึงต้องหันไปพึ่งคอง ยักษ์ใหญ่แห่งเกาะกะโหลก เพื่อร่วมมือกันไขปริศนาเบื้องหลังการโจมตีครั้งนี้ แต่เมื่อทั้งสองต้องเผชิญหน้ากันในสมรภูมิเดือด ใครกันแน่ที่จะเป็นผู้ปกครองโลกที่แท้จริง? การต่อสู้ครั้งนี้จะตัดสินชะตากรรมของทุกสรรพสิ่ง
